PubChem je baza podataka u otvorenom pristupu američkog Nacionalnog instituta za zdravlje (National Institutes of Health – NIH) koja pokriva znanstveno polje kemije. PubChem je jedan od ključnih izvora kemijskih informacija za znanstvenike, studente i širu javnost, a sadrži male molekule, ali i veće molekule kao što su nukleotidi, ugljikohidrati, lipidi, peptidi i kemijski modificirane makromolekule. Također prikuplja podatke o kemijskim strukturama, identifikatorima, kemijskim i fizičkim svojstvima, biološkim aktivnostima, patentima, podacima o zdravlju, sigurnosti, toksičnosti i mnoge druge.